"Что и как возможно защитить в нашем случае, и нужно ли это?"

     При защите разработок вопрос возможности - не стоит.
     Защитить можно всё что угодно, не существует технических решений, не подпадающих под защиту.
     Вопрос с нужностью/необходимостью уже сложнее.
     Любая защита строится не сама по себе, чтобы "было", а от конкретных угроз, соответственно по угрозе и защита.
     Защита необходима в ситуациях, когда существуют:
     1. Конкуренты/партнёры, которые могут ваши разработки присвоить себе
     2. Конкуренты/партнёры, которые могут обвинить вас в присвоении их разработки
     3. Ваши собственные разработчики, которые могут разработку присвоить себе, передать кому то, или раскрыть
     4. Фин.агенты (акционеры, инвесторы, банки, страховщики, и т.д.) для работы с которыми стоимость компании надо максимально увеличить (включив IP в Goodwill, проведя лицензирование и т.д.)
     5. Потребности в проведении трансграничных переводов финансовых средств без перемещения реальных товаров
     Эти ситуации имеют разную природу, и могут в той или иной пропорции комбинироваться.
     Ситуация № 1. - очевидна.
     Так как защитить можно всё, причём одновременно несколькими способами, объекты и формы защиты необходимо определять исходя из экономической целесообразности (стоимость защиты VS потенциальный ущерб).
     По ситуации № 2. - см. например ЗДЕСЬ.
     Ситуация № 3. - разобрана ЗДЕСЬ.
     В ситуации № 4 финдиректор (IR-менеджер для акционерной компании) должен определить параметры IP, которые нужны для нормального Goodwill-а. (для разных типов компаний и разных типов бизнесов существуют принятые соотношения %% оборотных средств, имущества, долгов, займов, и т.д., включая и IP), а так же какие примерно IP нужны (кто и как будет их оценивать у оценщиков, по какой методике, и т.д.).
     И исходя из этих данных станет понятно что требуется. (собрать всё что разработчики наразрабатывали, и раскидать это по десятку полезных моделей РФ, или выбрать наиболее важное и стоящее, и провести полное международное патентование, и т.д. и т.п., возможностей здесь миллион).
     При ситуации № 5 патенты (а точнее лицензионные платежи) применяются в качестве инструментов налоговой/платёжной/инвестиционной оптимизации, соответственно актуальной является сама исходная задача, будь это репатриация чёрной выручки, покупка зарубежной недвижимости, развод, эмиграция, или выплата зарплаты.
     Поэтому выбор методов и видов решений определяется этой исходной задачей, а патенты выступают в качестве одного из инструментов.
     Любая защита это инструмент.
     А любой инструмент полностью определяется решаемой задачей.